MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013124	CAGC	2	8	98274	98281	25 %	0 %	25 %	50 %	256370914
2502	NC_013124	CGC	2	6	98284	98289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370914
2503	NC_013124	CG	4	8	98370	98377	0 %	0 %	50 %	50 %	256370914
2504	NC_013124	CGA	2	6	98394	98399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370914
2505	NC_013124	CGC	2	6	98442	98447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370914
2506	NC_013124	ACG	2	6	98453	98458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370914
2507	NC_013124	CTG	2	6	98460	98465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370914
2508	NC_013124	GC	3	6	98489	98494	0 %	0 %	50 %	50 %	256370914
2509	NC_013124	CAC	2	6	98533	98538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370914
2510	NC_013124	ACC	2	6	98597	98602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370914
2511	NC_013124	GC	3	6	98628	98633	0 %	0 %	50 %	50 %	256370914
2512	NC_013124	TTCG	2	8	98707	98714	0 %	50 %	25 %	25 %	256370914
2513	NC_013124	AGC	2	6	98813	98818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370914
2514	NC_013124	CGC	2	6	98827	98832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370914
2515	NC_013124	GGT	2	6	98868	98873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370914
2516	NC_013124	GAG	2	6	98875	98880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370914
2517	NC_013124	GCC	2	6	98890	98895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370914
2518	NC_013124	CCA	2	6	98898	98903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370914
2519	NC_013124	GC	3	6	98910	98915	0 %	0 %	50 %	50 %	256370914
2520	NC_013124	AGG	2	6	98924	98929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370914
2521	NC_013124	GAT	2	6	98938	98943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370914
2522	NC_013124	GGTG	2	8	98958	98965	0 %	25 %	75 %	0 %	256370914
2523	NC_013124	TGA	2	6	98991	98996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370914
2524	NC_013124	CGT	2	6	99279	99284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370914
2525	NC_013124	CG	4	8	99384	99391	0 %	0 %	50 %	50 %	256370914
2526	NC_013124	TCGG	2	8	99407	99414	0 %	25 %	50 %	25 %	256370914
2527	NC_013124	TCGCG	2	10	99421	99430	0 %	20 %	40 %	40 %	256370914
2528	NC_013124	CCT	2	6	99441	99446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370914
2529	NC_013124	ACC	2	6	99492	99497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370914
2530	NC_013124	CGA	2	6	99507	99512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370914
2531	NC_013124	CGAC	2	8	99554	99561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_013124	CGGT	2	8	99562	99569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_013124	GCC	2	6	99599	99604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_013124	GTC	2	6	99618	99623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_013124	CGC	2	6	99642	99647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_013124	CAGC	2	8	99701	99708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_013124	GAGG	2	8	99763	99770	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_013124	GCC	2	6	99876	99881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_013124	GT	3	6	99924	99929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_013124	CGG	3	9	99930	99938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_013124	GGT	2	6	99970	99975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_013124	GGGA	2	8	100011	100018	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_013124	CA	3	6	100022	100027	50 %	0 %	0 %	50 %	256370915
2544	NC_013124	GAC	2	6	100040	100045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370915
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2548	NC_013124	ACG	2	6	100193	100198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370915
2549	NC_013124	CGT	2	6	100293	100298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370915
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2556	NC_013124	ATC	2	6	100669	100674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370915
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2559	NC_013124	CGG	2	6	100723	100728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_013124	TGC	2	6	100729	100734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_013124	CAC	2	6	100761	100766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_013124	CGC	2	6	100784	100789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370916
2563	NC_013124	TGGCTC	2	12	100808	100819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370916
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2572	NC_013124	GGGA	2	8	101085	101092	25 %	0 %	75 %	0 %	256370916
2573	NC_013124	CCT	2	6	101101	101106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370916
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2577	NC_013124	CGG	2	6	101183	101188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370916
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2579	NC_013124	TCG	2	6	101472	101477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370916
2580	NC_013124	GTC	2	6	101492	101497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370916
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2583	NC_013124	CGT	2	6	101590	101595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370916
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2587	NC_013124	CCTCCG	2	12	101859	101870	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_013124	GTGGC	2	10	101881	101890	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2589	NC_013124	CGCC	2	8	101893	101900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2590	NC_013124	CGT	2	6	101908	101913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_013124	TCG	2	6	102064	102069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_013124	TCG	2	6	102091	102096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_013124	G	6	6	102176	102181	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_013124	CA	3	6	102207	102212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_013124	CCG	2	6	102218	102223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_013124	CCG	2	6	102248	102253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2597	NC_013124	CGC	2	6	102293	102298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_013124	GGAG	2	8	102445	102452	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_013124	CTC	2	6	102524	102529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_013124	CGG	2	6	102590	102595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370917
2601	NC_013124	GCC	2	6	102606	102611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370917
2602	NC_013124	CGAGC	2	10	102644	102653	20 %	0 %	40 %	40 %	256370917
2603	NC_013124	CGC	2	6	102667	102672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370917
2604	NC_013124	GTC	2	6	102683	102688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370917
2605	NC_013124	GTGAC	2	10	102714	102723	20 %	20 %	40 %	20 %	256370917
2606	NC_013124	AGC	2	6	102806	102811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370917
2607	NC_013124	AGC	2	6	102822	102827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370917
2608	NC_013124	GGTC	2	8	102843	102850	0 %	25 %	50 %	25 %	256370917
2609	NC_013124	CGATC	2	10	102879	102888	20 %	20 %	20 %	40 %	256370917
2610	NC_013124	AGC	2	6	102918	102923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370917
2611	NC_013124	GTC	2	6	102947	102952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370917
2612	NC_013124	CGG	2	6	103060	103065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370917
2613	NC_013124	CG	3	6	103117	103122	0 %	0 %	50 %	50 %	256370917
2614	NC_013124	GA	3	6	103144	103149	50 %	0 %	50 %	0 %	256370917
2615	NC_013124	GAGG	2	8	103169	103176	25 %	0 %	75 %	0 %	256370917
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2622	NC_013124	GGTG	2	8	103450	103457	0 %	25 %	75 %	0 %	256370917
2623	NC_013124	GT	3	6	103511	103516	0 %	50 %	50 %	0 %	256370918
2624	NC_013124	TGAG	2	8	103525	103532	25 %	25 %	50 %	0 %	256370918
2625	NC_013124	GGTT	2	8	103557	103564	0 %	50 %	50 %	0 %	256370918
2626	NC_013124	GACC	2	8	103628	103635	25 %	0 %	25 %	50 %	256370918
2627	NC_013124	TCG	2	6	103636	103641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370918
2628	NC_013124	TCG	2	6	103717	103722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370918
2629	NC_013124	CGT	2	6	103758	103763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370918
2630	NC_013124	TGG	2	6	103771	103776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370918
2631	NC_013124	CGT	3	9	103798	103806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370918
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2682	NC_013124	GGAG	2	8	105394	105401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2742	NC_013124	AGCC	2	8	107817	107824	25 %	0 %	25 %	50 %	256370921
2743	NC_013124	TCG	2	6	107834	107839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370921
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2861	NC_013124	GTGC	2	8	112322	112329	0 %	25 %	50 %	25 %	256370925
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2865	NC_013124	GACG	2	8	112639	112646	25 %	0 %	50 %	25 %	256370925
2866	NC_013124	CG	3	6	112657	112662	0 %	0 %	50 %	50 %	256370925
2867	NC_013124	GTC	3	9	112753	112761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370925
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2869	NC_013124	AGC	2	6	112823	112828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370925
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2871	NC_013124	ACC	2	6	112850	112855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370925
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2881	NC_013124	CGA	2	6	113406	113411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370925
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2989	NC_013124	CGA	2	6	117546	117551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370927
2990	NC_013124	GCG	2	6	117562	117567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370927
2991	NC_013124	GCCG	2	8	117675	117682	0 %	0 %	50 %	50 %	256370927
2992	NC_013124	CGG	2	6	117684	117689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370927
2993	NC_013124	GAG	2	6	117791	117796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370927
2994	NC_013124	GATC	2	8	117810	117817	25 %	25 %	25 %	25 %	256370927
2995	NC_013124	TCG	2	6	117827	117832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370927
2996	NC_013124	CG	3	6	117875	117880	0 %	0 %	50 %	50 %	256370927
2997	NC_013124	TCGA	2	8	117922	117929	25 %	25 %	25 %	25 %	256370927
2998	NC_013124	CGT	2	6	117945	117950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370927
2999	NC_013124	GC	4	8	117951	117958	0 %	0 %	50 %	50 %	256370927
3000	NC_013124	GGA	2	6	117963	117968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370927

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